Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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Atg4aQ8C9S8 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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Atg4aQ8C9S8 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Atg4aQ8C9S8 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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Atg4aQ8C9S8 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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Atg4aQ8C9S8 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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Atg4aQ8C9S8 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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Atg4aQ8C9S8 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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Atg4aQ8C9S8 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Atg4aQ8C9S8 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Atg4aQ8C9S8 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Atg4aQ8C9S8 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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Atg4aQ8C9S8 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Atg4aQ8C9S8 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Atg4aQ8C9S8 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Atg4aQ8C9S8 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Atg4aQ8C9S8 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Atg4aQ8C9S8 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Atg4aQ8C9S8 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Atg4aQ8C9S8 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Atg4aQ8C9S8 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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