Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rbbp4Q60972 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rbbp4Q60972 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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