Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm26324-201ENSMUST00000083073 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm26127-201ENSMUST00000083193 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm25577-201ENSMUST00000083414 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm24861-201ENSMUST00000083459 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm25627-201ENSMUST00000084003 153 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm24547-201ENSMUST00000158649 149 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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