Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Trim71Q1PSW8 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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