Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm24916-201ENSMUST00000157287 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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Ebf1Q07802 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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Ebf1Q07802 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ebf1Q07802 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ebf1Q07802 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ebf1Q07802 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ebf1Q07802 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ebf1Q07802 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ebf1Q07802 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ebf1Q07802 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ebf1Q07802 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ebf1Q07802 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ebf1Q07802 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ebf1Q07802 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ebf1Q07802 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ebf1Q07802 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ebf1Q07802 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ebf1Q07802 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms