Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Hoxd1Q01822 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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