Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RabggtbP53612 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
RabggtbP53612 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtbP53612 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtbP53612 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtbP53612 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RabggtbP53612 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
RabggtbP53612 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
RabggtbP53612 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RabggtbP53612 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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