Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RxraP28700 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RxraP28700 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RxraP28700 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RxraP28700 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RxraP28700 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RxraP28700 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RxraP28700 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RxraP28700 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RxraP28700 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RxraP28700 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RxraP28700 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RxraP28700 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RxraP28700 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RxraP28700 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RxraP28700 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RxraP28700 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RxraP28700 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RxraP28700 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RxraP28700 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RxraP28700 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RxraP28700 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RxraP28700 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RxraP28700 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RxraP28700 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RxraP28700 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RxraP28700 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RxraP28700 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RxraP28700 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RxraP28700 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RxraP28700 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RxraP28700 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RxraP28700 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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