Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Nedd9O35177 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nedd9O35177 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nedd9O35177 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nedd9O35177 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Nedd9O35177 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nedd9O35177 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Nedd9O35177 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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