Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm22938-201ENSMUST00000103956 120 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm23166-201ENSMUST00000157164 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm23315-201ENSMUST00000158003 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm24946-201ENSMUST00000158332 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC125190.3-201ENSMUST00000223224 121 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm22078-201ENSMUST00000157593 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm24108-201ENSMUST00000175495 77 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Mir28c-201ENSMUST00000200096 75 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NebE9Q1W3 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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