Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm22431-201ENSMUST00000158545 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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Trabd2bB1ATG9 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Trabd2bB1ATG9 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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Trabd2bB1ATG9 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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Trabd2bB1ATG9 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
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Trabd2bB1ATG9 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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Trabd2bB1ATG9 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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Trabd2bB1ATG9 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Trabd2bB1ATG9 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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Trabd2bB1ATG9 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Trabd2bB1ATG9 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Trabd2bB1ATG9 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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Trabd2bB1ATG9 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Trabd2bB1ATG9 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Trabd2bB1ATG9 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trabd2bB1ATG9 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trabd2bB1ATG9 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trabd2bB1ATG9 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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Trabd2bB1ATG9 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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Trabd2bB1ATG9 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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Trabd2bB1ATG9 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
Trabd2bB1ATG9 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trabd2bB1ATG9 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Trabd2bB1ATG9 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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