Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm12013-201ENSMUST00000121971 155 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Spocd1B1ASB6 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Spocd1B1ASB6 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Spocd1B1ASB6 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spocd1B1ASB6 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spocd1B1ASB6 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spocd1B1ASB6 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spocd1B1ASB6 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spocd1B1ASB6 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spocd1B1ASB6 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Spocd1B1ASB6 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Spocd1B1ASB6 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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