Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Cln8Q9QUK3 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Cln8Q9QUK3 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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