Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
Rabgef1Q9JM13 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Rabgef1Q9JM13 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
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