Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RabggtaQ9JHK4 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms