Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
Usp29Q9ES63 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp29Q9ES63 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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