Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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Ccdc39Q9D5Y1 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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Ccdc39Q9D5Y1 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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Ccdc39Q9D5Y1 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc39Q9D5Y1 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc39Q9D5Y1 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc39Q9D5Y1 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms