Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm25884-201ENSMUST00000157782 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc47Q9D024 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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