Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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Sgo1Q9CXH7 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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Sgo1Q9CXH7 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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Sgo1Q9CXH7 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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Sgo1Q9CXH7 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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Sgo1Q9CXH7 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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Sgo1Q9CXH7 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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Sgo1Q9CXH7 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Sgo1Q9CXH7 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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