Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ddb2Q99J79 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ddb2Q99J79 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ddb2Q99J79 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ddb2Q99J79 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Ddb2Q99J79 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ddb2Q99J79 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ddb2Q99J79 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Ddb2Q99J79 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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Ddb2Q99J79 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ddb2Q99J79 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ddb2Q99J79 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ddb2Q99J79 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Ddb2Q99J79 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
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Ddb2Q99J79 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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Ddb2Q99J79 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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Ddb2Q99J79 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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Ddb2Q99J79 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Ddb2Q99J79 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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Ddb2Q99J79 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ddb2Q99J79 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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Ddb2Q99J79 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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Ddb2Q99J79 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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Ddb2Q99J79 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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Ddb2Q99J79 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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Ddb2Q99J79 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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Ddb2Q99J79 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ddb2Q99J79 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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