Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp38Q8BW70 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp38Q8BW70 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp38Q8BW70 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp38Q8BW70 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp38Q8BW70 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp38Q8BW70 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp38Q8BW70 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp38Q8BW70 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp38Q8BW70 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp38Q8BW70 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp38Q8BW70 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp38Q8BW70 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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