Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm23751-201ENSMUST00000157583 136 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Mir5124b-201ENSMUST00000184251 85 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Mir302c-201ENSMUST00000083548 68 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC-0.58□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.58□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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