Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Prdm1Q60636 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prdm1Q60636 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms