Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Trim71Q1PSW8 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trim71Q1PSW8 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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