Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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ptchd1Q14B62 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ptchd1Q14B62 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ptchd1Q14B62 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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