Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hif3aQ0VBL6 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms