Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Hoxd1Q01822 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Hoxd1Q01822 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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