Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm11116-201ENSMUST00000113257 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
Rps29P62274 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm23216-201ENSMUST00000179545 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Rps29P62274 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm25600-201ENSMUST00000158357 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Mir7057-201ENSMUST00000184685 58 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Rps29P62274 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm25601-201ENSMUST00000158356 105 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Mir677-202ENSMUST00000197076 78 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Mir302c-201ENSMUST00000083548 68 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Rps29P62274 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps29P62274 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm27935-201ENSMUST00000183894 79 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Mir7651-201ENSMUST00000184154 64 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps29P62274 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Mir7015-201ENSMUST00000199525 64 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps29P62274 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Rps29P62274 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms