Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PtprmP28828 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PtprmP28828 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC0□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PtprmP28828 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PtprmP28828 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PtprmP28828 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PtprmP28828 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PtprmP28828 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
PtprmP28828 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Gm24372-201ENSMUST00000104400 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PtprmP28828 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PtprmP28828 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PtprmP28828 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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