Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RxraP28700 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RxraP28700 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RxraP28700 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RxraP28700 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RxraP28700 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RxraP28700 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RxraP28700 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RxraP28700 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RxraP28700 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RxraP28700 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
RxraP28700 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
RxraP28700 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RxraP28700 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RxraP28700 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RxraP28700 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RxraP28700 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RxraP28700 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RxraP28700 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RxraP28700 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RxraP28700 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RxraP28700 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RxraP28700 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
RxraP28700 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RxraP28700 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RxraP28700 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RxraP28700 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RxraP28700 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RxraP28700 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RxraP28700 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RxraP28700 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RxraP28700 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RxraP28700 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RxraP28700 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RxraP28700 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RxraP28700 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RxraP28700 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RxraP28700 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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