Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P10404 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P10404 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P10404 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P10404 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P10404 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
P10404 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
P10404 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P10404 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P10404 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P10404 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P10404 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
P10404 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
P10404 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
P10404 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
P10404 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
P10404 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
P10404 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
P10404 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
P10404 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
P10404 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
P10404 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
P10404 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
P10404 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
P10404 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
P10404 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
P10404 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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P10404 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
P10404 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
P10404 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
P10404 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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P10404 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
P10404 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
P10404 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
P10404 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
P10404 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
P10404 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
P10404 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
P10404 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
P10404 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
P10404 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
P10404 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
P10404 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
P10404 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
P10404 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
P10404 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
P10404 Gm22490-201ENSMUST00000157188 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
P10404 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
P10404 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
P10404 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
P10404 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
P10404 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
P10404 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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