Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Spta1P08032 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Spta1P08032 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Mir6339-201ENSMUST00000185120 117 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Mir7057-201ENSMUST00000184685 58 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Spta1P08032 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Spta1P08032 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
Spta1P08032 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
Spta1P08032 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
Spta1P08032 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
Spta1P08032 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Spta1P08032 Gm23072-201ENSMUST00000158243 123 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Spta1P08032 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
Spta1P08032 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Spta1P08032 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Spta1P08032 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Spta1P08032 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Spta1P08032 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Spta1P08032 Gm27935-201ENSMUST00000183894 79 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Spta1P08032 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms