Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MttpO08601 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MttpO08601 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MttpO08601 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MttpO08601 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MttpO08601 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MttpO08601 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MttpO08601 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MttpO08601 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
MttpO08601 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
MttpO08601 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MttpO08601 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MttpO08601 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MttpO08601 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MttpO08601 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
MttpO08601 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
MttpO08601 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MttpO08601 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
MttpO08601 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
MttpO08601 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MttpO08601 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MttpO08601 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MttpO08601 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MttpO08601 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MttpO08601 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MttpO08601 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MttpO08601 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MttpO08601 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MttpO08601 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MttpO08601 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MttpO08601 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MttpO08601 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MttpO08601 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MttpO08601 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
MttpO08601 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MttpO08601 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MttpO08601 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MttpO08601 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MttpO08601 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MttpO08601 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms