Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Zfp558E9Q1J0 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
Zfp558E9Q1J0 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms