Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm25681-201ENSMUST00000083938 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Spocd1B1ASB6 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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