Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Grik3B1AS29 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Grik3B1AS29 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.7 ms