Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn8Q9Z260 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn8Q9Z260 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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