Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Nphp1Q9QY53 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Nphp1Q9QY53 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms