Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtaQ9JHK4 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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