Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp12Q9D9M2 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Usp12Q9D9M2 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.3 ms