Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ttc9bQ9D6E4 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ttc9bQ9D6E4 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms