Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
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Ccdc39Q9D5Y1 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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Ccdc39Q9D5Y1 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccdc39Q9D5Y1 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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