Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Zbed3Q9D0L1 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Zbed3Q9D0L1 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Zbed3Q9D0L1 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
Zbed3Q9D0L1 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
Zbed3Q9D0L1 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Zbed3Q9D0L1 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Zbed3Q9D0L1 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Zbed3Q9D0L1 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Zbed3Q9D0L1 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Zbed3Q9D0L1 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Zbed3Q9D0L1 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zbed3Q9D0L1 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zbed3Q9D0L1 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zbed3Q9D0L1 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zbed3Q9D0L1 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zbed3Q9D0L1 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zbed3Q9D0L1 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zbed3Q9D0L1 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zbed3Q9D0L1 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zbed3Q9D0L1 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zbed3Q9D0L1 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zbed3Q9D0L1 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zbed3Q9D0L1 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zbed3Q9D0L1 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zbed3Q9D0L1 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zbed3Q9D0L1 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms