Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc47Q9D024 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc47Q9D024 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc47Q9D024 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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