Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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Sgo1Q9CXH7 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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Sgo1Q9CXH7 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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Sgo1Q9CXH7 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Sgo1Q9CXH7 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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Sgo1Q9CXH7 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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Sgo1Q9CXH7 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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Sgo1Q9CXH7 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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Sgo1Q9CXH7 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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Sgo1Q9CXH7 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Sgo1Q9CXH7 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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