Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn16Q925N4 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn16Q925N4 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms