Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Usp38Q8BW70 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Usp38Q8BW70 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms