Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC-0.5□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm26043-201ENSMUST00000116912 91 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm25297-201ENSMUST00000175490 67 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Mir677-202ENSMUST00000197076 78 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm26131-201ENSMUST00000082725 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
NipblQ6KCD5 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
NipblQ6KCD5 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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