| Hoxa13 | Q62424 | Mir3092-201 | ENSMUST00000174954 | 96 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm25476-201 | ENSMUST00000175125 | 185 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm21903-201 | ENSMUST00000178039 | 90 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm23963-201 | ENSMUST00000179603 | 77 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm37918-201 | ENSMUST00000192071 | 120 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm44922-201 | ENSMUST00000206690 | 90 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | AC154282.1-201 | ENSMUST00000223154 | 265 nt | BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Il1rapl1-202 | ENSMUST00000113964 | 1936 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.87 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm44644-202 | ENSMUST00000208825 | 3133 nt | TSL 2 BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Tlr7-201 | ENSMUST00000060719 | 3776 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.86 | □□□□□ -1.95 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm23040-201 | ENSMUST00000083869 | 163 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Skint5-203 | ENSMUST00000170105 | 4434 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Defb43-201 | ENSMUST00000100491 | 408 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm22658-201 | ENSMUST00000104196 | 155 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm26405-201 | ENSMUST00000158495 | 100 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm42623-201 | ENSMUST00000197225 | 379 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm22421-201 | ENSMUST00000083058 | 107 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm24453-201 | ENSMUST00000083346 | 76 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm37566-201 | ENSMUST00000192363 | 4355 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Olfr869-201 | ENSMUST00000213024 | 1783 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Vmn1r76-202 | ENSMUST00000226300 | 8189 nt | APPRIS ALT2 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Zfp273-201 | ENSMUST00000012725 | 2277 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm22752-201 | ENSMUST00000102083 | 109 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm25529-201 | ENSMUST00000104850 | 92 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | AC151902.2-201 | ENSMUST00000226419 | 301 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm22297-201 | ENSMUST00000083312 | 106 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Hif1a-202 | ENSMUST00000110461 | 4385 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Vmn1r29-203 | ENSMUST00000227761 | 4671 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Vmn1r29-205 | ENSMUST00000228909 | 4658 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Slain1os-201 | ENSMUST00000160117 | 3101 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Mgat4c-211 | ENSMUST00000163753 | 3862 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | AW554918-203 | ENSMUST00000100131 | 1684 nt | TSL 5 BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | U2surp-202 | ENSMUST00000079659 | 7630 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Lipi-201 | ENSMUST00000062721 | 2082 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm23803-201 | ENSMUST00000104610 | 132 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm23101-201 | ENSMUST00000157550 | 137 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Mir1951-201 | ENSMUST00000157981 | 89 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm22606-201 | ENSMUST00000158290 | 103 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm25012-201 | ENSMUST00000158396 | 164 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm22853-201 | ENSMUST00000174974 | 131 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Mir3106-201 | ENSMUST00000175401 | 82 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm21798-201 | ENSMUST00000180105 | 261 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Igkv4-60-201 | ENSMUST00000200639 | 358 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | CT030687.1-201 | ENSMUST00000221854 | 162 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm25204-201 | ENSMUST00000082843 | 106 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm43379-201 | ENSMUST00000196253 | 7726 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm37664-201 | ENSMUST00000194607 | 3813 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm15861-201 | ENSMUST00000120979 | 339 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm25961-201 | ENSMUST00000157174 | 135 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm23600-201 | ENSMUST00000157260 | 71 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm23277-201 | ENSMUST00000157914 | 136 nt | BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm43562-201 | ENSMUST00000196439 | 238 nt | TSL 3 BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |