Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
Sft2d1Q5SSN7 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Mir142b-201ENSMUST00000083486 115 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.24□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms